Ataköy'deki Olimpiyatevi'nde gerçekleştirilen kura çekimine, 3. turdan gelen 27 takım ile bu sezon Avrupa kupalarında Türkiye'yi temsil eden Fenerbahçe, Galatasaray, Trabzonspor, Bursaspor ve Eskişehirspor takımları katıldı.
Kupada 2. turdan itibaren mücadele eden Beşiktaş MKE Ankaragücü'yle, kuraya bu turdan giren Fenerbahçe Pendikspor'la, Galatasaray Balıkesirspor'la, Trabzonspor Şanlıurfaspor'la, Bursaspor Nazilli Belediyespor'la, Eskişehirspor da Polatlı BUGSAŞ Spor ile eşleşti.
Ziraat Türkiye Kupası'nda 4. tur maçları 27, 28 ve 29 Kasım tarihlerinde, tek maç eleminasyon sistemine göre oynanacak.
-Fenerbahçe-Pendikspor eşleşmesi-Kupanın en ilginç eşleşmesi Fenerbahçe ile Pendikspor arasında oldu.
Bu sezon 3. turda Spor Toto Süper Lig ekiplerinden Sanica Boru Elazığspor'u eleyen Spor Toto 2. Lig ekibi Pendikspor, 1999-2000 sezonunda elediği Fenerbahçe ile eşleşti. Eşleşmenin gerçekleşmesi sırasında kura çekiminin yapıldığı salonda gülüşmeler yaşandı.
1999-2000 sezonunda Türkiye Kupası 3. turunda Fenerbahçe ile eşleşen Pendikspor, sarı-lacivertli rakibini sahasında 2-1 yenerek tur atlamayı başarmıştı. Fenerbahçe bu karşılaşmada Metin Diyadin'in golüyle öne geçmesine rağmen Pendikspor karşılaşmayı penaltıdan Seçkin Boylu ve Mustafa Ateş'in golleriyle 2-1 kazanarak tarihi bir sürprize imza atmıştı.
-Eşleşmeler-Trabzonspor-Şanlıurfaspor
TKİ Tavşanlı Linyitspor-Medical Park Antalyaspor
Adanaspor-1461 Trabzon
Polatlı BUGSAŞ Spor-Eskişehirspor
Gençlerbirliği-Bandırmaspor
Tokatspor-Mersin İdmanyurdu
Kasımpaşa-Bayrampaşaspor
Altay-Kayseri Erciyesspor
Beşiktaş-MKE Ankaragücü
Nazilli Belediyespor-Bursaspor
Galatasaray-Balıkesirspor
Bozüyükspor-Gaziantepspor
Sivasspor-Manisaspor
Gaziantep Büyükşehir Belediyespor-Kardemir Karabükspor
Fenerbahçe-Pendikspor
Göztepe-Orduspor